De nieuwe iPad Mini 3 is volgens iFixit moeilijk te repareren, dit komt omdat de nieuwe TouchID vingerafdruksensor is vastgelijmd aan het scherm. Vervanging van het scherm zou ervoor kunnen zorgen dat de TouchID sensor niet langer werkt. De bevindingen staat online in het rapport van iFixit.
In vergelijking met de iPad Mini 2 zijn er nauwelijks verschillen. Bij de presentatie bleek al dat Apple nauwelijks veranderingen heeft doorgevoerd aan de kleine tablet; alleen de TouchID sensor is nieuw en daarnaast wordt de iPad Mini 3 ook in drie kleuren verkocht, waaronder goud.
Apple heeft de nieuwe TouchID sensor bevestigd aan het frontpaneel met lijm, hierdoor is het zeer moeilijk om het scherm te vervangen van de iPhone. Gebruikers die het scherm willen vervangen dienen dus de homeknop los te halen en opnieuw vast te lijmen aan het nieuwe paneel. iFixit heeft de iPad Mini 3 een reparatie score gegeven van 2 uit 10.
